增值税进项税抵扣的原则：必须有票才能抵扣。发票，尤其是增值税专用发票，企业收到后必须要严格管理，否则可能会影响到抵扣，对企业就是额外的损失。
不过，并不是所有的增值税专用发票都能抵扣，以下一些情形是值得注意的。
1、虚开的发票不能抵扣
虚开的发票是不能抵扣的，甚至可能面临严重的出发。按照规定，只要实际业务与发票内容不符，就可能涉嫌虚开。财务人员在审核时，务必要从业务真实性出发，同时结合企业财务管理制度的要求。
很典型的案例：员工出差报销住宿费，如果员工的行程本是1月30号结束，结果他自行安排了出差地的旅游，发生了额外的住宿费。那么，这额外的住宿费能否报销？住宿费的进项能否抵扣呢？
严格意义来说，这也是属于虚开。公司若是想规避这类风险，最好在财务管理制度里有明确的规定，以后就有据可行。
2、票面信息不合规的发票不能抵扣
增值税专用发票对票面打印有很多要求。
完整的公司名称、税号、地址、银行账号，都属于必须信息；
备注栏打印的内容要符合要求：
收款人、开票人、复核人必须要完整；
税额必须单独列示；
发票章必须清晰；
套打位置不能有偏离，尤其是密码区；
。。。
这些都是要仔细检查的。之前就有位朋友说，他曾把发票章盖反了，最后对方不收，不得不重开发票；我也曾收到过一张密码区打偏的发票，财务一看就说退回去。这都是保持谨慎原则。
票面信息中还需要尤其注意购买方的【名称】，有些业务是必须开单位才可以的，比如材料采购；有些开给个人也可以，比如话费发票；还有些特定的三方业务，发票的名称是第三方单位，有合同等单据，也是可以的。
3、税法规定的“不得抵扣”的项目，即便有发票也不能抵扣
《增值税暂行条例》里，规定的不能用于抵扣的项目主要有这些：
用于免征增值税项目：最典型如避孕药品，销售是免增值税的，那制造这些产品的原材料进项税，就不能抵扣。
用于非增值税项目：以前是指营业税项目，现在比较典型的是简易计税的项目，进项不能抵扣。（也包括适用征收率的小规模纳税人）
用于个人消费 比如买苹果手机，奖励给优秀员工。
用于职工福利 比如职工食堂采购的发票，
非正常损失的项目 非正常损失是指：因管理不善造成被盗、丢失、霉烂变质的损失，以及被执法部门依法没收或者强令自行销毁的货物。 像315查出来没收销毁的伪劣产品，这些产品对应的采购进项肯定是不能抵扣的。再有买回来后在仓库保管的商品，被偷了，那采购的进项也不能抵扣。
以上，其实就是常说的要做“进项转出”的那些业务，即便有合法合规的增值税专用发票 ，也不能抵扣。
4、假发票、作废的发票、没有认证的发票不能抵扣
假发票、作废的发票自然是不能抵扣的。增值税发票管理系统支持增值税普通发票和增值税专用发票的查验，直接输入发票号码就可以。如果系统里查不到，那票自然有问题，如果票查到了，但发票状态不对，也是有问题的。
如果发票已经认证和抵扣，最后对方又作废了，这种特殊情形也需要注意。
5、其它特殊情形
一般纳税人身份的公司，没有健全的会计核算，简单说就是账不清楚，那么税务局机关可能会做出处罚：不得抵扣进项。
类似的还有，小规模纳税人达标后，没有转登记为一般纳税人，税务机关同样可能做出处罚：不得抵扣进项。
自然，这些公司拿到的进项发票也是不能抵扣的。
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