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应纳税额=应纳税所得额×适用税率-减免税额-抵免税额
(一)直接计算法
应纳税所得额=收入总额-不征税收入-免税收入-各项扣除-允许弥补的以前年度亏损
(二)间接计算法：
应纳税所得额=会计利润总额±纳税调整项目金额
(一)核定征收企业所得税的范围
1、依法可以不设置账簿的;
2、依法应当设置但未设置账簿的;
3、擅自销毁账簿或者拒不提供纳税资料的;
4、虽设置账簿，但账目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全，难以查账的;
5、发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的;
6、申报的计税依据明显偏低，又无正当理由的。
自2012年1月1日起，专门从事股权(股票)投资业务的企业，不得核定征收企业所得税。对依法按核定应税所得率方式核定征收企业所得税的企业，取得的转让股权(股票)收入等转让财产收入，应全额计入应税收入额，按照主营项目(业务)确定适用的应税所得率计算征税。若主营项目(业务)发生变化，应在当年汇算清缴时，按照变化后的主营项目(业务)重新确定适用的应税所得率计算征税。
(二)核定征收的办法
应纳所得税额=应纳税所得额×适用税率
应纳税所得额=应税收入额×应税所得率
或应纳税所得额=成本(费用)支出额÷(1-应税所得率)×应税所得率
纳税人的生产经营范围、主菅业务发生重大变化，或者应纳税所得额或应纳税额增减变化达到20%的，向税务机关申报调整已确定的应纳税额或应税所得率。
(一)对于在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的非居民企业的所得，按照下列方法计算应纳税所得额：
1、股息、红利等权益性投资收益和利息、租金、特许权使用费所得，以收入全额为应纳税所得额。
2、转让财产所得，以收入全额减除财产净值后的余额为应纳税所得额。财产净值是指财产的计税基础减除已经按照规定扣除的折旧、折耗、摊销、准备金等后的余额。
股权转让收入减除股权净值后的余额为股权转让所得应纳税所得额。股权净值(计税基础)是股权转让人投资入股时向中国居民企业实际支付的出资成本，或购买该项股权的原转让人实际支付的股权受让成本。股权在持有期间发生减值或者增值，应进行相应调整。企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权可能分配的金额。多次收购通向股权部分转让的，按比例计算被转让股权对应成本。
3、其他所得，参照前两项规定的方法计算应纳税所得额。
4、扣缴企业所得税应纳税额的计算×实际征收率
扣缴企业所得税应纳税额=应纳税所得额×实际征收率
(二)非居民企业所得税核定征收办法
1、按收入总额核定应纳税所得额
应纳税所得额=收入总额×经税务机关核定的利润率
2、按成本费用核定应纳税所得额
应纳税所得额=成本费用总额÷(1-经税务机关核定的利润率)×经税务机关核定的利润率
3、按经费支出换算收入核定应纳税所得额
应纳税所得额=经费支出总额÷(1-经税务机关核定的利润率)×经税务机关核定的利润率(不低于15%)
4、税务机关可按照以下标准确定非居民企业的利润率：
(1)从事承包工程作业、设计和咨询劳务的，利润率为15%-30%;
(2)从事管理服务的，利润率为30%-50%;
(3)从事其他劳务或劳务以外经营活动的，利润率不低于15%。
税务机关有根据认为非居民企业的实际利润率明显高于上述标准的，可以按照比上述标准更高的利润率核定其应纳税所得额。
5、非居民企业与中国居民企业签订机器设备或货物销售合同，同时提供设备安装、装配、技术培训、指导、监督服务等劳务，其销售货物合同中未列明提供上述劳务服务收费金额，或者计价不合理的，主管税务机关可以根据实际情况，参照相同或相近业务的计价标准核定劳务收入。无参照标准的，以不低于销售货物合同总价款的10%为原则，确定非居民企业的劳务收入。
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