公路水运监理工程师与水利监理工程师不一样。
公路水运监理工程师属于交通运输部管理的，报考的时候选择交通运输专业，考试的时候专业科目选择水运专业作答；水运一般指水上交通相关的工程，如港口、航道、船闸、船舶等。
水利监理工程师属于水利部管理，报考的时候选择水利工程专业。水利一般指农田水利、河道整治、河流的防洪兴利（水坝、电站、引水渠、航运）等。
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监理工程师专业注册分类
监理工程师报名是分土木建筑工程专业、交通运输工程专业和水利工程专业。取得资格证书后，每人可根据报名专业选择对应专业注册，每人最多可以申请两个专业注册。
| 报名专业 | 可注册专业 | 主管部门 |
| 土木建筑工程 | 房屋建筑工程、冶炼工程、矿山工程、化工石油工程、水利水电工程、电力工程、农林工程、铁路工程、公路工程、港口与航道工程、航天航空工程、通信工程、市政公用工程、机电安装工程。 | 住房和城乡保障部 |
交通运输工程 （公路工程/水运工程） | 选择注册公路工程专业类别的，可以从道路与桥梁、隧道工程、公路机电工程3个注册专业中，选择注册2个专业； 选择注册水运工程专业类别的，可以从港口工程、航道工程、水运机电工程3个注册专业中，选择注册2个专业。 | 交通运输部 |
| 水利工程 | 水利工程施工监理、水土保持工程施工监理、机电及金属结构设备制造监理、水利工程建设环境保护监理四个专业。 | 水利部 |
土木建筑工程专业由住房和城乡建设部负责；交通运输工程专业由交通运输部负责；水利工程专业由水利部负责。
