发挥水利建设的有利影响 减免其不利影响
任何大的工程，不论地理位置如何，都有正影响和负影响，合理的方法是应该同时考虑正的和负的影响，并努力争取正影响最大而负影响最小，假如把注意力只集中在正影响或负影响方面而不考虑另一方面的影响，水工程的潜在的整体效益将得不到发挥，有时还会作出错误的决策。
要有生态观点与系统观点
生物在自然界中并不是孤立地生存着，它们总是结合成生物群落而生存的。这种生物群落和它们的生存环境的综合体，就是生态系统。河流、湖泊和流域都是生态系统，因此在进行水利建设时就不能把它们单纯地作为资源的总体，从人类的要求出发，进行开发利用；还应该保护珍贵的自然资源、珍稀物种和维持人类与自然界生存、发展的协调性和和谐性。在规划和兴建水工程之先必须研究流域或地区内现有生态系统的作用，识别和维护现有生态系统为进一步合理开发的价值。
运用生态系统方法于规划、研究和管理一个水环境或一个流域，不是偶然的，它是管理方法历史演进到最近阶段的发展。它把人类放在系统内部并作为该系统的一个主要组成部分，所以生态系统的方法是全面的、完整的、符合实际的，也是体现开发建设整体性思想的发展。
发挥水工程改善水质、保护环境、维护生态平衡的作用
利用水库调度改善环境，是水工程大有可为的一个方面。长江三峡水库在综合利用调度中已在研究进一步改善上、中、下游及河口生态环境的调度问题。为改善第二松花江水质，丰满水库、白山水库已在研究联合运转的库容分配与调度方式、丰满水库最小下泄流量问题。广西漓江为枯季旅游，已研究了补水方案。广东东江流域控制性水库，已提出了调整功能增加枯水流量的建议。有些研究和建议，在经济建设中都有重大意义。
广东佛山水道在５０年代治理时，没有从长远着想，缺乏环境水利规划，实施后引起河水严重污染，经扩建沙口闸引水，提高稀释自净能力后，佛山市汾江污染得以改善。
此外，如杭州西湖和南京秦淮河等地也都分别利用水工程引水、换水，使污染治理收到一定的效果。
接受国际、国内水利建设与环境影响的经验教训
１、各项水工程，特别是大型水资源开发工程，对环境产生影响是肯定的，但以往不为人们所重视，今后必须在此类工程的规划设计中，提到应有的高度来认识，并对环境保护效益与投资进行研究，综合选定开发方案。对一时搞不清的环境问题，在规划中要留有余地。
２、砍伐森林对水资源的影响也是肯定的。森林生态不仅可提供商品，而且对稳定土壤、防洪和调节气候等都有作用，此外，还可为动物提供生境。砍伐森林就破坏了上述作用，特别是减少了土地的吸收、储蓄和调节河水的能力，因此，砍伐森林造成的经济损失远不如生态作用的损失。
３、对流域或地区都需要有包括环境问题在内的全面、完整的规划。环境问题大多可以预测，因而可以事先提出防治措施。重要的教训是需要更多、更好的规划指导开发。从调查确定任务，论证开发的可能性，进行可行性研究，直到最终实行开发都需要有环境保护和对不利影响减免措施的规划。
４、要重视城市化和城市发展所引起的环境问题及对水资源的新的要求。城市化是土地利用的一种方式，从战略高度考虑，需要统一考虑流域内土地利用与水资源的开发问题。
５、要落实对环境不利影响的减免措施。水工程引起的环境不利影响一般是可以采取措施减免的。问题在于落实措施并加强监测、调整。这种采取措施、减免不利影响的方法，在水工程的实践中是值得提倡的。
坚持水工程环境影响评价制度
江河流域规划和水工程环境影响评价的目的，是从合理利用自然资源、保护环境、促进环境质量、维护生态平衡等观点出发，根据不同工程方案的技术、经济和环境指标，优选方案，在规划、设计、施工和管理等阶段分别提出减免不利影响和发挥有利影响的措施。
环境影响评价的开展，不仅使环境保护由消极地治理走向积极地预防阶段，使环保工作由被动转向主动，更重要的是它可使水工程发挥更大的综合利用效益，而使不利影响减到最小。环境影响评价涉及到社会、经济、物理、化学、生物、生态、水利等十分广泛的自然科学与社会科学领域，因此必须由这些领域的专家通力协作，共同完成。
正确处理水利发展与环境的关系，必须把环境问题作为规划、设计的组成部分，统一比选方案；或根据一般做法，在水工程或流域开发方案形成后对各个方案进行环境影响评价，对方案的比选从环境方面提出意见，然后统一优选方案，以实现经济效益、社会效益和环境效益的协调统一。
由于进行环境影响评价所需费用、人力以及技术水平较高，费时较长，常影响工程项目的立项和实施，因此，在发展中国家还应探索一套简单、易行、能说明问题的方法。
还须说明：评价只是一种揭示问题的手段，而不是目的，更重要的，是在工程确定实施后，要进行环境管理规划，根据规划进行监测和管理。
