4 水资源开发中的主要问题
4.1 源流区大量开荒，自用水量急剧增加，导致汇入干流的水量减少
据统计，在1949─1993年期间，尽管源流区的水资源趋于增加，但由于其新增灌溉面积太多，达42.54万hm2，引水率已提高到80%以上，甚至接近100%，导致汇入干流区的水量不断下降。据统计，干流来水量90年代与50年代相比减少了16.8亿m3.干流来水组成也发生了变化，即大部分是回归水和农田排水，由此导致了干流河水矿化度的升高。
4.2 干流区上游引水过多，下游来水量急剧下降
干流区除了来水量有所减少、质量有所下降外，还出现了上游引水量增多，用水份额加大，下游来水量和用水份额急剧减少的问题。从表2可以看出，最近几十年，干流各区段的耗水量发生了很大变化。其中，上游耗水量从50年代的14.8亿m3增加到90年代的17.1亿m3，耗水份额由26.4%增加到43.5%；中游耗水量由50年代的25.8亿m3减少至90年代19.2亿m3，但耗水份额相对稳定，维持在46%~50%之间；下游段耗水量减少较多，由50年代的15.6亿m3减少到90年代的3.1亿m3，耗水份额由27.7%下降到7.8%.有关资料表明，上游沙雅县境内和中游尉犁县境内的开荒尤为严重，估计每年在1万hm2以上。为了满足新增耕地的用水需求，上游下段和中游乱扒的引水口多达300余处，致使下游来水量由50年代的15.6亿m3剧减为90年代3.1亿m3，减少了80%.由于下游来水量减少，大西海子水库的蓄水量满足不了当地灌区的用水需求，新疆塔里木河管理局准备实施的向“绿洲走廊”应急输水0.8亿m3的目标未能实现。
由于竞相引水，干流来水量愈往下游递减得越快。在阿拉尔至新满渠180 km内，每km减少360万m3；新满渠至大坝284 km，每km减少400万m3；大坝至恰拉的203 km区段内，每km减少1 010万m3.下游的总来水量从50年代的14.8亿m3减少到4.64亿m3，减少了69%，铁干里克的来水量由8.5亿m3减少到0.06亿m3，减少了99.3%.阿拉干和罗布庄则分别断流了25年和27年。
4.3 流域内水利基础设施薄弱
无论是源流区还是干流区，所建的都是引水工程，基本上没有控制性水利工程，加上水利工程严重老化，水毁工程修复缓慢，对水资源的宏观调控能力很低；基本上没有采用工程治理措施，河道处于自然状态，洪水来时到处漫流，大量水资源被蒸发、渗漏掉了；枯水季节，水质咸化，又不适于灌溉；渠系衬砌率低，输水过程中的渗漏非常严重，损耗率高达60%～65%，以致每hm2耕地的灌溉用水达到16 500~22 500 m3.
4.4 缺乏流域总体规划
流域内各地州、各部门各自为政，水资源缺乏统一管理。源流区和干流中上游随意取水现象比较严重，到达下游的水量越来越少，越来越难以维持农田灌溉和生态需水。
5 提高水资源利用效率的措施
5.1 实行全流域水资源的统一管理和配置
为了有效地协调源流区与干流区的关系，干流区上中下游的关系，以及生产、生活与生态用水的关系，实现塔里木河流域的可持续发展，必须对塔里木河流域进行统一管理。1） 强化管理、监督，实行干流、源流水资源一体化管理，按照大流域的概念对分源流、干流所做的流域规划作必要的补充、修改和调整，提高它们之间的耦合性。2） 在源流区实行定额限量引水，确保塔里木河干流来水量不低于47.1亿m3，其中，源流区来水量不低于43.6亿m3，“引孔济塔”水量不低于3.5亿m3.为了拯救下游绿色走廊，近期要确保有2亿m3水量泄往大西海子以下，远期达到2.5亿m3.
5.2 借助于水价和水权交易等手段，提高水资源利用效率
从供给角度看，水价必须反映水资源的稀缺程度，从需求角度看，水价要反映水资源可带来的边际效益。有了这样的价格信号，就会诱发源流区和干流区开展旨在提高水资源利用效率的技术创新，实现由增引地表水到转向开发地下水的转变。所谓水权交易，则是为了实现“双赢”。
5.3 依靠技术创新和工程建设，提高水资源的可利用性
据业内人士估计，工程措施可挖潜的水资源达7.39亿m3，其中上游段2.46亿m3，中游段4.93亿m3；节水2.79亿m3.其中上游0.82亿m3；中游1.97亿m3.具体措施包括疏通河道，修建控制闸，封堵非法引水口，减少湖区蒸发耗水等。源流区内潜水位在0～2 m的面积有7 500 km2，潜水蒸发量达47.7亿m3.通过开发地下水替 代一部分地表水，不仅可利于提高向塔里木河干流输水的保证程度，而且可获得良好的生态效益。开发地下水的投资也不会高，一般都低于修建水库的投资，经济效益也是好的。
塔里木河流域的水资源利用应实行维护生态与发展生产相结合原则。生态用水按维护现有生长较好的植被面积计算约需31.23亿m3，生产用水可达到9.66亿m3，扣除水库、湖泊、湿地、河流水面蒸发损失6.4亿m3，生态与生产用水比例大体为3：1.干流各区段的水量的分配应按地域相对平衡，上、中游各占源流来水份额的42.5%，即18.5亿m3，下游占15%，达到6.5亿m3.下游再加上孔雀河供水3.5 亿m3，合计10.0亿m3，就可满足维护下游绿色走廊用水。
