1、基差风险。基差是指1股票现货指数价格与最近月份指数期货价格之价差，套期保值交易效果常常受基差变动的影响，基差风险是影响套期保值交易效果的主要因素。理论上，基差具有收敛性，随着到期日接近，现货指数与指数期货价格渐趋一致，但如果保值期与期货合约到期日不一致，存在基差风险。对于采取对股指期货合约进行滚动保值策略的投资者而言，则存在合约展期所出现的不利价格变化风险。
2、交叉套期保值风险。如果要保值的资产与股指期货标的指数走势并不完全一致，则存在交叉保值风险。股票组合的市场风险度量的是组合的系统风险，可以进行对冲，而非系统风险则不能对冲。股票组合的非系统风险，并不随交割期临近而趋向于0。如果组合相对于沪深300(3292.128,0.00,0.00%)指数的β值过高或过低、以及β值的时变性，存在一定程度的交叉套期保值风险。因此，投资者首先应对个股的β值进行分析，通常对β值比较接近于1的股票所构成的组合进行套期保值。
3、逐日结算风险。由于股指期货交易实行保证金交易和逐日结算制度，因此一旦出现不利变动，投资者可能被要求将保证金补足到规定的水平。如果资金周转不足，可能无法及时补足保证金而被强行平仓，套期保值策略由此落空，亏损可能更严重。
4、期现市场交易规则的差异风险。由于股指期货市场采取T＋0交易制度，而目前股市采取的是T+1交易制度。投资者的指数套利交易可能会出现现货头寸不能当日对冲的问题，从而导致套利成本的增加乃至套利交易的失效。
