参考答案：
问题1.(1)工程预付款 (25000 - 3800)×20% = 4240(万元);
(1)1～6月份计划完成产值= 350 + 400 + 650 + 800 + 900 + 1000 = 4100(万元) > 4000(万元);
所以预付款应从开工后第7个月起扣。
问题2. (1)不妥之处：建设单位同意补偿工程实体损失40万元，工期不予顺延。
正确做法：建设单位应补偿工程实体损失和临时设施损失共计43.5万元，工期顺延5天。
问题3.(1)第4月应签认的进度款= 800×90% = 720(万元)，
(1)第5月应签认的进度款=[ 9000000 + (80×75 + 150×100)×(1+8%)×(1+3%) ]×90%= 8121024.36(元)= 812.10 (万元);
(2)第6月应签认的进度款 [ 1000 + 18.5×(1+12%)×(1+7%)×(1+8%)×(1+3%) ]×90% = 923.78(万元);
(3)第7月应签认的进度款1200×90% - 4240 / 5 = 232(万元)。
问题4. (1)①在建永久工程损失20万元——应由建设单位承担;
②进场待安装的设备损失3.2万元——应由建设单位承担;
③施工机具闲置损失8万元——应由施工单位承担;
④工程清理耗费5万元——应由建设单位承担;
(2)建设单位应承担的损失费合计： 20 + 3.2 + 5 = 28.20 ( 万元 )。
