目前，在螺杆式冷水机组中，有的双机头机组的制冷剂回路采用的是完全独立的回路，即相对于每台压缩机，制冷剂从蒸发器到压缩机再到冷凝器，流经过滤干燥器、EXV和孔板再回到蒸发器的整个流动过程是完全独立的，如图1所示。除了蒸发器和冷凝器管程流动的水是串联以外，制冷剂回路的完全独立使得双机头机组实际上完全相当于两台完全独立的机组。
这种完全独立的制冷剂回路有以下好处：
A.制冷剂回路系统设计相对简单，可以完全复制单机头机组的管路系统设计做法，因此，性能如消耗功率、COP与单机头机组基本上具有相同性，冷量可以简单地是单机头机组的二倍关系。
B.制冷剂回路完全独立，一个回路的任何情况不会对另一个回路产生任何影响，比如一个回路的压缩机需要维修时，对另一个回路没有任何影响，油系统不会互相干扰，从而提高了机组运行的可靠性。
C.控制相对简单，由于两个回路互相之间不发生影响，每个回路都有单独冷凝温度、蒸发温度和排气温度等的单独检测，因此每个回路可以实现单独的控制，使得排气温度的控制和防止失油的保护都比较可靠。
总而言之，独立的双制冷剂回路系统的优点是技术难度较低而使机组的可靠性较高。由于以上优点，很多螺杆机和离心机厂家都采用了这种技术方案，比如国内厂家的绝大部分干式蒸发器多机头螺杆机组，以及生产满液式机组的开利公司的30HX系列中双机头螺杆机组，美佳的PFH系列离心机组，特灵的CDHG系列大型离心机组。但是，这种独立的回路系统技术方案也有以下缺点：
A.制造成本高。由于两套回路完全独立，因而管路系统特别是液体管路需要准备两套，这些零件包括电子膨胀阀、过滤干燥器、球阀等；控制检测和保护元件如蒸发温度和冷凝温度的传感器及变送器需要准备两套；在容器上除了胀接工作量加倍外，需要增加蒸发器和冷凝器中间管板各两块，需要增加中间垫片各一块。
B.部分负荷性能不能充分发挥优势。由于两个回路系统完全独立，当一台压缩机停机时，空闲的一半蒸发和冷凝面积不能被另一台压缩机所利用，限制了部分负荷时性能的提高潜力。
C.机组维修不方便。这种不方便特别表现在：
1）当清洗铜管时，由于铜管可能没有完全对正而使清洗毛刷可能不能通过容器的整个长度，将增加清洗需要打开另端水室的工作量。
2）尽管目前还未出现双机头机组铜管冻破和磨破的事故，但万一出现这种问题，在进行拔堵换管操作时，机组需要完全解体，这将大大地延长维修时间，增加维修工作量；
D.限制了机组上使用压缩机的数量，为了避免换热器管程水压降太大，制冷剂多回路机组一般最多使用两个压缩机。
