四、跨地区经营汇总缴纳企业所得税征收管理
(一)适用范围
跨省市总分机构企业是指跨省(自治区、直辖市和计划单列市，下同)设立不具有法人资格分支机构的居民企业。总机构和具有主体生产经营职能的二级分支机构就地预缴企业所得税。
三级及三级以下分支机构，其营业收入、职工薪酬和资产总额等统一并入二级分支机构计算。
不具有主体生产经营职能且在当地不缴纳营业税、增值税的产品售后服务、内部研发、仓储等企业内部辅助性的二级分支机构以及上年度符合条件的小型微利企业及其分支机构，不实行本办法。
(二)税款预缴
由总机构统一计算企业应纳税所得额和应纳所得税额，并分别由总机构、分支机构按月或按季就地预缴。
1．分支机构分摊预缴税款。总机构在每月或每季终了之日起十日内，按照上年度各省市分支机构的营业收入、职工薪酬和资产总额三个因素，将统一计算的企业当期应纳税额的50％在各分支机构之间进行分摊(总机构所在省市同时设有分支机构的，同样按三个因素分摊)，各分支机构根据分摊税款就地办理缴库，所缴纳税款收入由中央与分支机构所在地按60：40分享。分摊时三个因素权重依次为0．35、0．35和0．3。当年新设立的分支机构
第二年起参与分摊；当年撤销的分支机构自办理注销税务登记之日起不参与分摊。各分支机构分摊预缴额按下列公式计算：各分支机构分摊预缴额=所有分支机构应分摊的预缴总额×该分支机构分摊比例其中：
所有分支机构应分摊的预缴总额=统一计算的企业当期应纳所得税额×50％该分支机构分摊比例=(该分支机构营业收入／各分支机构营业收入之和)×0．35+(该分支机构职工薪酬／各分支机构职工薪酬之和)×0．35+(该分支机构资产总额／各分支机构资产总额之和)×O．30
2．总机构就地预缴税款。总机构应将统一计算的企业当期应纳税额的25％，就地办理缴库，所缴纳税款收入由中央与总机构所在地按60：40分享。
3．总机构预缴中央国库税款。总机构应将统一计算的企业当期应纳税额的剩余25％，就地全额缴入中央国库，所缴纳税款收入60％为中央收入，40％由财政部按照2004年至2006年各省市三年实际分享企业所得税占地方分享总额的比例定期向各省市分配。
(三)汇总清算
企业总机构汇总计算企业年度应纳所得税额，扣除总机构和各境内分支机构已预缴的税款，计算出应补应退税款，分别由总机构和各分支机构(不包括当年已办理注销税务登记的分支机构)就地办理税款缴库或退库。
1．补缴的税款按照预缴的分配比例，50％由各分支机构就地办理缴库，所缴纳税款收入由中央与分支机构所在地按60：40分享；25％由总机构就地办理缴库，所缴纳税款收入由中央与总机构所在地按60：40分享；其余25％部分就地全额缴入中央国库，所缴纳税款收人中60％为中央收入，40％由财政部按照2004年至2006年各省市三年实际分享企业所得税占地方分享总额的比例定期向各省市分配。
2．多缴的税款按照预缴的分配比例，50％由各分支机构就地办理退库，所退税款由中央与分支机构所在地按60：40分担；25％由总机构就地办理退库，所退税款由中央与总机构所在地按60：40分担；其余25％部分就地从中央国库退库，其中60％从中央级1010442项“总机构汇算清缴所得税”下有关科目退付，40％从中央级1010443项“企业所得税待分配收入”下有关科目退付。
(四)其他
跨省市总分机构企业缴纳的所得税查补税款、滞纳金、罚款收入，按中央与地方60：40分成比例就地缴库。需要退还的所得税查补税款、滞纳金和罚款收入仍按现行管理办法办理审批退库手续。
五、合伙企业所得税的征收管理
合伙企业以每一个合伙企业为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税；合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。
【提示】合伙企业采用“先分后税”的原则。
六、新增企业所得税征收管理范围调整
自2009年1月1日起，新增企业所得税纳税人中，应缴纳增值税的企业，其企业所得税由国税局管理；应缴纳营业税的企业，其企业所得税由地税局管理。以2008年为基年，2008年年底之前国税局、地税局各自管理的企业所得税纳税人不作调整。
从2009年起，企业所得税全额为中央收入的企业和在国税局缴纳营业税的企业，其企业所得税由国税局管理。银行(信用社)、保险公司的企业所得税由国税局管理。除前述规定外的其他各类金融企业的企业所得税由地税局管理。外商投资企业和外国企业常驻代表机构的企业所得税仍由国税局管理。
