沉井下沉至设计标高，应检验基底的地质情况是否与设计相符，排水下沉时，可直接检验、处理；不排水下沉时，应进行水下检查、处理，必要时取样鉴定。不排水下沉的沉井基底应平整，且无浮泥。排水下沉的沉井，应满足基底面平整的要求。还应进行沉降观测，经过观测在8h内累计下沉量不大于10mm或沉降率在允许范围内，沉井下沉已稳定时，即可进行沉井封底。
沉井封底可分为排水封底和不排水封底两种，当沉井基底无渗水或少量渗水时可用排水封底；当沉井基底有较大量渗水时需采用不排水封底。
1．排水封底
基底岩面平整，刃脚周围经用黏土或水泥砂浆封堵后，井内无渗水时，可在基底无水的情况下灌注封底混凝土。若刃脚经封堵后仍有少量渗水、但易于抽干时，则可采用排水封底。这种方法是将新老混凝土接触面冲刷干净或打毛，对井底进行修整，使之成锅底形，由刃脚向中心挖成放射形排水沟，填以卵石作成滤水暗沟，在中部设2～3个积水井，深l～2 m，井间用盲沟相互连通，插入φ600～φ800 mm四周带孔眼的钢管或混凝土管，管周填以卵石，使井底的水流汇集在井中，用泵排出，并保持地下水位低于井内基底面0．3 m。
封底一般先浇一层素混凝土垫层，达到50％设计强度后，绑扎钢筋，两端深入刃脚或槽内，浇筑上层底板混凝土。浇筑应在整个沉井面积上分层、同时不断地进行，由四周向中央推
进，每层厚300～500 mm，并用振捣器捣实。但应注意层与层间浇筑时间间隔不得超过初凝时间，并插入下层50mm。当井内有隔墙时应前后左右对称地逐孔浇筑。混凝土采用自然养护，养护期间应继续抽水。待底板混凝土强度达到70％后，对集水井逐个停止抽水，逐个封堵。封堵方法是，将滤水井中的水抽干，在套筒内迅速用干硬性的高强度混凝土进行堵塞并捣实，然后上法兰盘盖，用螺栓拧紧或焊牢，上部用混凝土填实捣平。
2．不排水封底
不排水封底即在水下进行封底。要求将井底浮泥清除干净，新老混凝土接触面用水冲刷干净，并铺碎石垫层。封底混凝土用导管法灌注或用推石灌浆法灌注。待水下封底混凝土达到设计要求强度后，即一般养护为7～10 d，方可从沉井中抽水，按排水封底法施工上部钢筋混凝土底板。